Την Τετάρτη 1/10 η αντιτρομοκρατική προχώρησε σε συντονισμένη επιχείρηση σε Αθήνα και Θεσσαλονίκη συλλαμβάνοντας 5 άτομα. Διοχέτευσε απ’ την πρώτη στιγμή στα ΜΜΕ ότι συνέλαβε «τρομοκράτες» που τάχα ετοίμαζαν χτύπημα, ενώ υποτίθεται ότι εμπλέκονταν σε δυο ληστείες. Επίσης τους είχαν εντάξει αυθαίρετα ως περιφερειακά μέλη της Συνωμοσίας Πυρήνων της Φωτιάς.

Την Παρασκευή 3/10 τα τρία από τα 5 άτομα πέρασαν από ανακριτή για τα αδικήματα της νομοθεσίας περί όπλων και της πλαστογραφίας, όπου και αφέθηκαν ελεύθεροι, ενώ σε κάποιους επιβλήθηκαν χρηματική εγγύηση και περιοριστικοί όροι (απαγόρευση εξόδου απ’ τη χώρα και παρών στο Α.Τ. της περιοχής τους).

Στις 6/10 πέρασαν από ανακριτή-εισαγγελέα τα δύο τελευταία άτομα της υπόθεσης που αναβάθμισε μιντιακά η αντιτρομοκρατική, οι οποίοι και οδηγήθηκαν στις φυλακές Κορυδαλλού (στο υπόγειο της ΣΤ πτέρυγας προστασίας).

Οι δύο προφυλακισμένοι σύντροφοι (οι οποίοι συνελήφθησαν σε σπίτι στο Κολωνάκι) είναι οι Παναγιώτης Μιχαλάκογλου και Μ.Β. Δεν κατηγορούνται για τρομοκρατική ή εγκληματική οργάνωση ούτε συνδέονται με ληστείες, όπως διέρρεε η αντιτρομοκρατική τις πρώτες μέρες. Οι κατηγορίες είναι: διακεκριμένη οπλοκατοχή και κατοχή εκρηκτικών (χειροβομβίδα).

Από την πρώτη στιγμή ο Παναγιώτης ανέλαβε την ευθύνη για τα όπλα που βρέθηκαν στο σπίτι του, ενώ ο Μ.Β. δεν έχει καμία σχέση με την υπόθεση.

Στα μέσα Οκτωβρίου έγινε μεταγωγή τους από τις φυλακές Κορυδαλλού: ο Παναγιώτης μεταφέρθηκε στις φυλακές Νιγρίτας Σερρών, ενώ ο Μ.Β. οδηγήθηκε στις φυλακές Αγίου Στεφάνου στην Πάτρα, όπου εξακολουθούν να κρατούνται σε πτέρυγες προστασίας. Από πλευράς συνηγόρων γίνονται προσπάθειες για αλλαγή της ακτίνας των συντρόφων.